신탁업자(자산보관회사)의 주요 업무는 투자신탁재산인 주식, 현금 등의 보관 및 관리입니다. 신탁업자는 일반적으로 시중은행이 되는데 지정참가회사가 투자자로부터 받은 주식을 신탁업자에 납입하게 되면 ETF가 해지될 때까지 해당 주식을 관리하며, ETF에 대한 해지 신청이 들어오면 반대로 보관하고 있던 주식을 지정참가회사에 돌려줍니다. 이 밖에 신탁업자는 집합투자업자의 투자신탁재산 운용지시에 따라 자산의 취득 및 처분을 이행하거나 수익증권의 환매대금 및 이익금을 지급하는 역할을 합니다. 또한 집합투자업자의 투자신탁재산 운용지시에 대한 감시업무를 수행하고 투자신탁재산 평가의 공정성 및 기준가격산정의 적정성 여부 확인 등을 수행합니다.